Přírodní památka vyhlášená v 2013 Krajským úřadem Jihočeského kraje na základě povinnosti implementace soustavy NATURA 2000 mezi česká chráněná území. Leží v katastrálním území Hluboká nad Vltavou a Bavorovice. Předmětem ochrany jsou ohrožení brouci, kteří jsou vázáni svým vývojem na staré dubové porosty; páchník hnědý (Osmoderma eremita), tesařík obrovský (Cerambyx cerdo) a roháč obecný (Lucanus cervus).
Páchník hnědý se vyvíjí v trouchu dutin starých listnatých stromů, především dubu a lípy. Tesařík obrovský napadá kmeny a silné větve odumírajících dubů a jeho ochrana bývá často v konfliktu s ochranou stromořadí a provozní bezpečností. Roháč obecný žije ve starých trouchnivých kmenech, pařezech a kořenech dubů. Je to největší evropský brouk, samci dorůstají až 80 mm.
Přírodní památku Hlubocké hráze tvoří zámecký park v krajinářském stylu, z velké části nově založený v polovině 19. století při novogotické přestavbě zámku na tehdejších polních pozemcích. Na park navazují louky, komunikace a rybniční hráze s liniovými porosty a solitéry dubů. Větší část území v údolí řeky Vltavy leží v jihovýchodní části Zlivské pánve, součásti Českobudějovické pánve, zámecký vrch v severní části lokality však již tvoří nejzápadnější výběžek Lišovského prahu. Krajinářský park u zámku, louky, komunikace a rybniční hráze s liniovými porosty lze obecně klasifikovat jako nelesní stromové výsadby, vlhké louky, krátkostébelné trávníky a intenzivně obhospodařované louky. Nepatrné zbylé fragmenty přirozených vlhkých luk v jižní části lokality hostí zbytkovou populaci žluťuchy lesklé (Thalictrum lucidum). Bohatá je xylofágní entomofauna, vázaná na duby. Z této kategorie se zde vyskytuje několik ohrožených druhů, mimo předměty ochrany např. kovařík rezavý (Elater ferrugineus), zdobenec proměnlivý (Gnorimus variabilis), nosorožík kapucínek (Oryctes nasicornis) a kovařík zlatopásý (Lacon querceus). Na vlhké louky s liniovými porosty různých dřevin jsou vázány další ohrožené druhy hmyzu, zejména střevlík Scheidlerův (Carabus scheidleri).
Vzhledem k bohaté potravní nabídce a k velkému množství hnízdních dutin zde žije řada ptáků, z těch vzácnějších např. strakapoud prostřední (Dendrocopos medius), lejsek šedý (Muscicapa striata), žluva hajní (Oriolus oriolus) či slavík obecný (Luscinia megarhynchos). Ve velkých dutinách dubů se ukrývá několik druhů netopýrů.
Cílem ochrany památky je udržet populace ohrožených druhů brouků a zajistit kontinuitu nabídky vhodných stromů k jejich vývoji. Zásadní je zastoupení dubu letního (Quercus robur) a dostatek jeho starých jedinců.